翼竜はどんなものを食べ、どんな暮らしをしていたのか、実際に化石などの資料から推測することができます。また、翼竜から世代交代した鳥類について、比較することで翼竜とはどんな生物であったかが明確に分かります。
翼竜のいた白亜紀にはすでに現在の鳥のもととなった原始の鳥類がいました。コンフエキソルニスという鳥です。中国ではけんされたこの鳥類は、翼竜と共存していたことが分かっており、昆虫や果物などを食べていたと考えられています。
現存するワタリアホウドリの骨格やコウモリを見ると翼竜の骨格との類似点などがわかります。